Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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ZNF239Q16600 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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ZNF239Q16600 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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ZNF239Q16600 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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