Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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