Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SF1Q15637 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SF1Q15637 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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