Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAF13Q15543 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms