Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RYR3Q15413 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms