Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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NECTIN1Q15223 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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NECTIN1Q15223 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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NECTIN1Q15223 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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NECTIN1Q15223 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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NECTIN1Q15223 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECTIN1Q15223 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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