Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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