Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNIP1Q15025 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNIP1Q15025 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms