Protein–RNA interactions for Protein: Q15006

EMC2, ER membrane protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC2Q15006 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EMC2Q15006 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms