Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLCA4Q14CN2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLCA4Q14CN2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 317 ms