Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GINS1Q14691 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms