Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDX39BQ13838 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDX39BQ13838 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms