Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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PKP1Q13835 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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PKP1Q13835 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP1Q13835 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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