Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTAN1Q13813 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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