Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKD2Q13563 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms