Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TOP3AQ13472 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms