Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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