Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PTGDRQ13258 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTGDRQ13258 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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