Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NME3Q13232 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NME3Q13232 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME3Q13232 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NME3Q13232 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
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