Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM2Q13029 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM2Q13029 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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