Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTP4A2Q12974 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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