Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms