Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPOCK1Q08629 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPOCK1Q08629 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms