Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms