Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KRTAP1-1Q07627 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms