Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms