Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms