Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A3Q01959 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms