Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms