Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DEFA6Q01524 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms