Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLCB2Q00722 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms