Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP1P63208 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP1P63208 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP1P63208 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP1P63208 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKP1P63208 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms