Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms