Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RPS28P62857 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
RPS28P62857 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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