Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF3P57682 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF3P57682 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF3P57682 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF3P57682 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF3P57682 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF3P57682 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF3P57682 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLF3P57682 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms