Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP6P55212 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP6P55212 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms