Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFDNP55196 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AFDNP55196 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AFDNP55196 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AFDNP55196 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFDNP55196 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AFDNP55196 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AFDNP55196 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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