Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GDF10P55107 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GDF10P55107 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GDF10P55107 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms