Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLTPP55058 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLTPP55058 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLTPP55058 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLTPP55058 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLTPP55058 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLTPP55058 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLTPP55058 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLTPP55058 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLTPP55058 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLTPP55058 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLTPP55058 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLTPP55058 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms