Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMP3P54852 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMP3P54852 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EMP3P54852 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EMP3P54852 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms