Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FNTBP49356 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTBP49356 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FNTBP49356 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms