Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms