Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms