Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCAMP43121 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCAMP43121 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCAMP43121 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms