Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms