Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms