Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CHRNA7P36544 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms