Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6V1E1P36543 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms