Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJA4P35212 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJA4P35212 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms