Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKARP32238 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms